消化爐在蛋白質檢測中起到了很重要的作用，選擇一臺合適的消化爐是準確檢測的前提。 1 溫度要恒定，波動要小，每個樣品可以有一致的消化時間，
2 每一個樣品孔溫度要一致，以免樣品消化時間相差太大。
3 能有效的控制溫度變化的過程，以免消化時的樣品掛壁。
4 效地保溫措施，以提高爐腔內溫度的恒定性
* 有效地溫度控制，使得消化能按需要控制溫度，如果有程序升溫控制就能有效達到所需。
* 很好的保溫措施，如果保溫材料勢單力薄，必造成溫度不穩定。儀器較厚的保溫層是溫度穩定的需要。故保溫材料的厚度和材質是一個重要的指標、
* 加熱體和熱載體的選擇，可以根據用戶的需要選擇不同的熱載體。下面我們來討論加熱體和熱載體的選擇。
現在加熱主要有二種方式比較好的。
# 紅外加熱，靠熱輻射來加熱樣品，特點是：升溫快，熱慣性小，溫控準確。一般應用于有高要求樣品的消化。例如：有較快的升溫和降溫速度。程序升溫可以使用戶更具自己樣品的特點來選擇升溫曲線，或選擇分段式的升溫，更有利益樣品的消化，從而杜絕樣品的掛壁現象、進而使得樣品消化效率的大大提高
# 鋁錠加熱，靠鋁錠傳導熱給樣品，特點：升溫較慢，熱慣性較大，溫度較穩定，還由于鋁錠的良好的熱傳導性，每個樣品孔間的溫度一致性好。廣泛應用于消化爐的熱載體，但也要注意：一片薄薄的鋁錠也不能保持溫度的恒定，所以選擇鋁錠消化爐，鋁錠厚度也是一個考察指標。
# 石墨加熱，靠石墨傳導給樣品熱量，特點：熱慣性大升溫較慢，由于石墨熱傳導性較差（相比較鋁錠），使得樣品孔間溫度不均勻，容易造成樣品間消化時間拉大。但是由于石墨成本較低，石墨消化爐成本便宜，對部分低端用戶有一定的吸引力。
其余要注意消化爐的保護功能： 溫度保護，過流和短路保護。
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