薄層色譜儀是一種用于分離和檢測化合物的儀器。它基于薄層色譜技術，通過將樣品溶液放置在一個均勻、細致地覆蓋在玻璃或塑料板上的吸附材料(如硅膠)上，并使用移動相沿著這個吸附材料表面逐漸進行分離。
薄層色譜又叫薄板層析，是色譜法中的一種，是快速分離和定性分析少量物質的一種很重要的實驗技術，屬固—液吸附色譜，它兼備了柱色譜和紙色譜的優點，一方面適用于少量樣品(幾到幾微克，甚至0.01微克)的分離；另一方面在制作薄層板時，把吸附層加厚加大，因此，又可用來精制樣品，此法適用于揮發性較小或較高溫度易發生變化而不能用氣相色譜分析的質。此外，薄層色譜法還可用來跟蹤有機反應及進行柱色譜之前的一種“預試”。
薄層掃描儀是可以對斑點進行掃描的專用分光光度計，用可見光或紫外光作光源，線性掃描或鋸齒掃描薄層板展開后的斑點，該斑點就吸收該組分特征波長的單色光，剩余的單色光經透射或反射或發射熒光，由檢測器積分起來，獲得這塊斑點面積的待測物質含量。
工作原理：
通常情況下，我們先選擇一小片經過特殊處理后的質量較好、耐酸堿性強并且具有良好抗靜電能力等性能好的硅膠G薄層板，并滴入待測試混合物到其一個端部中央區域位置處。之后，在梳形樣線起始點處加入移動相(即流體載體)，使其從初始點開始延伸至另外一個端部位置。
隨著時間推進，樣品成分在吸附材料表面不斷地向前遷移并與流動相發生交互反應。由此可以根據每種組分所對應出現條帶長度及顏色差異比較來確定其含量大小以及純度程度等信息。而且可采用多種定性以及定量手段(如顯微鏡、紫外分光等)來進一步確認結果的準確性。
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