用作填充色譜柱柱管的材料通常有不銹鋼管、銅管、鋁管、銅鍍鎳管、玻璃管以及聚四氟乙烯管等。銅管和鋁管由于催化活性太強且易變形已不太常用。分析用的填充柱內徑一般采用2-4mm，制備用的柱內徑可大些，一般使用5-10mm。長度可選擇1-5m。柱子的形狀可以是螺旋形的，也可以是U型的。使用后者較易獲得較高的柱效。如果使用螺旋形的，應注意柱圈徑的大小對柱效會有一定的影響，一般柱圈徑應比柱內徑大15倍。
柱材料的選擇應依據待分析的樣品性質和實驗條件而定。如果待分析的樣品易分解或具有腐蝕性，應考慮使用玻璃管或聚四氟乙烯管。玻璃管柱的優點是化學惰性好，制備的柱子柱效高，便于觀察柱子的填充情況，但玻璃管易碎是其缺點。聚四氟乙烯管的優點是耐腐蝕，缺點是不耐高溫高壓。在填充柱中目前zui常使用的是不銹鋼管。它的zui大優點是不破碎，傳熱性能好，柱壽命長，能滿足常見樣品分析的要求。缺點是內壁較粗糙，有活性，比較難于清洗干凈。
填充柱的柱管在使用前應該經過清洗處理和試漏檢查。清洗的方法與柱管材料有關。對于不銹鋼管，通常先用10%熱氫氧化鈉水溶液浸泡，抽洗除去管內壁的油污，然后用自來水洗至中性。如果用1:20,的稀鹽酸水溶液重復處理一次，則可顯著降低柱內壁的吸附作用。玻璃柱的清洗可參照上面所述的方法，不同的是通常使用洗液浸泡。同樣，為了減少玻璃內壁的活性，可以用5%二甲基二氯硅烷的甲苯溶液浸泡處理，然后用甲苯和甲醇分別沖洗干凈。柱子的檢漏方法比較簡單：可將柱子泡在水里，堵死柱的一端，在另一端通氣，若無氣泡冒出即說明柱子無泄漏現象。