1、定期更換氣體凈化器填料變色硅膠可據顏色變化來判斷其性能，但分子篩等吸附有機物的凈化器就不好用肉眼判斷了。所以須定期更換，3個月更換一次。如果硅膠與分子篩裝在一起，則更換硅膠時也要更換分子篩。
2、按儀器說明書的規程操作
驗收儀器時，不僅要清點所有零部件是否齊全，還要檢查儀器說明書是否齊備，并妥善保存這些資料。在獨立操作儀器之前，一定要認真閱讀有關說明書，并嚴格按規程操作。這是做好儀器分析的前提條件，而且一旦儀器出了問題，也好與廠商交涉。
3、使用純度合乎要求的載氣
載氣一定要用高純級的，以避免干擾分析和污染色譜柱或檢測器。要知道一根色譜柱的價格是一瓶高純氮氣或氫氣價格的20倍以上。如果因為要省錢而用普通氣體作載氣，可能是丟了西瓜揀了芝麻。檢測器用輔助氣體也用高純級的。雖然在靈敏度要求不高時，可用普通氣體，但其代價可能是檢測器被污染。及時更換色譜柱密封墊。
4、及時更換石墨密封墊
石墨密封墊漏氣是GCzui常見的故障之一。一定不要在不同的柱上重復使用同一密封墊，即使同一根柱卸下重新安裝時，也要換新密封墊，這樣能保證更高的工作效率。如果裝上色譜柱后發現漏氣而再更換密封墊，就要花費更多的時間，即使舊墊仍能使用，也要比原來多擰緊一些，弄得不好就會擰斷毛細管色譜柱。
5、定期檢查并清洗進樣襯管
儀器長期使用后，進樣襯管內會有焦油狀物質，這是樣品中的不揮發成分造成的。此外還會有顆粒狀物質積存(隔墊碎屑，樣品中的固體物質)這些都會干擾分析的正常進行。因此要定期檢查，及時清洗。注意，在襯管中填充一些經硅烷化處理的石英玻璃毛，既可提高樣品的汽化效率，又能防止隔墊碎屑進入色譜柱造成堵塞。
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