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            PicoPLEX技術助力輔助生殖研究

            閱讀:1434發(fā)布時間:2020-10-10

             
             
            輔助生殖技術(包括人類輔助生殖技術和人類精子庫)是指運用醫(yī)學技術和方法對配子、合子、胚胎進行人工操作,以達到受孕目的的技術,分為人工授精技術、體外受精-胚胎移植技術及相關衍生技術【1】
             
            其中體外受精-胚胎移植技術及其各種衍生技術(In vitro fertilization, IVF)近些年來備受關注。簡單的說,就是大家耳熟能詳?shù)?span style="color:rgb(255, 0, 0); font-family:& font-size:11pt">試管嬰兒技術。
             
            “試管嬰兒”的前世今生?
            1978年世界上*試管嬰兒誕生,從此開創(chuàng)了生殖醫(yī)學領域的新紀元。
            試管嬰兒是指從女性體內取出卵子,在器皿內培養(yǎng)后,加入經技術處理的精子,待卵子受精后,繼續(xù)培養(yǎng),到形成早早期胚胎時,再轉移到子宮內著床,發(fā)育成胎兒直至分娩的技術【1】
             
            試管嬰兒技術的分類
             
            第三代試管嬰兒的分類
             
            為什么選擇PGT-A?
            雖然試管嬰兒技術給不能孕育的夫婦帶來了希望,但胚胎染色體數(shù)目異常在常規(guī)體外受精中較常發(fā)生,且高齡女性胚胎染色體異常的發(fā)生率更高。
            PGT-A技術,對植入前的胚胎細胞進行染色體非整倍體以及染色體拷貝數(shù)變異檢測,選擇染色體數(shù)目正常的胚胎,可有效提高體外受精的成功率,有助于輔助生殖技術的推廣應用。
             
            PGT-A的研究方法
            前幾年主要通過熒光原位雜交(FISH)技術、比較基因組雜交芯片(aCGH)技術進行PGT-A分析。隨著二代測序(NGS)的快速發(fā)展,人們將目光轉向NGS方法,以期進行更正確的評估。
             
            PGT-A研究的難點之一是選擇合適的單細胞全基因組擴增技術
            基于NGS技術進行PGT-A研究時,由于每個胚胎細胞中的DNA非常少(皮克級),遠沒有達到測序所需的樣品量,因此需要先對單細胞內的DNA進行全基因組擴增(whole genome amplification, WGA),而這一過程必須盡可能避免樣本的損失和污染,并盡可能保證擴增的覆蓋度、均一性等,這都是極其困難的,所以選對單細胞全基因組擴增技術很重要
             
            Takara致力于為科學研究提供支持,傾力推出的PicoPLEX技術,目前廣泛用于PGT-A研究。接下來讓我們一起來看一下:
             
            PicoPLEX技術是如何正確而高效的進行PGT-A研究
            ■ 操作簡便,避免珍貴樣品的損失
            整個實驗過程是 “飛一般的感覺”(見下圖),就三小時,就三小時(細胞裂解→預擴增→低背景的PCR擴增),便可獲得微克級的DNA產物。過程中不需要轉管和純化,減少過多實驗操作可能帶來的樣本損失!
             
             
            ■ 炫酷的“準線性預擴增+發(fā)夾結構”加持,保證擴增的均一性
            在經過細胞裂解后,以DNA作為模板使用準線性擴增方法進行預擴增,并在每個循環(huán)后形成一個不能被進一步擴增的發(fā)夾結構,這樣做的好處是有效避免PCR過程中可能引入的擴增錯誤無限放大,避免序列偏向性。
             
            ■ 可用于高品質的染色體變異(CNV)分析
            利用單卵裂球活體組織檢查樣品進行PicoPLEX WGA Kit擴増標記后,與24 sure array雜交,結果清晰地顯示了CNV(上圖)。2011年ESHRE(歐洲人類生殖與胚胎學會)的臨床實驗證明了采用PicoPLEX 技術進行人類染色體核型分析的準確性。
             
            ■ 實例大公開:進行PGT研究時,PicoPLEX性能出色
            來自西班牙Sistemas Genómicos Ltd.的Vendrell【2】的團隊,開發(fā)了一種高度可靠的檢測單個卵裂球和5-10滋養(yǎng)外胚層細胞樣品的染色體異倍性的實驗方法。其中使用PicoPLEX試劑盒擴增獲得gDNA產物用于后續(xù)NGS分析。實驗表明,未擴增的對照DNA樣品和來自單個卵裂球的WGA產物在測序數(shù)據(jù)上基本沒有差異,且可以正確地檢測染色體異倍性。
            表明使用PicoPLEX技術具有高再現(xiàn)性,適用于PGT-A分析。
             
            拓展:無創(chuàng)胚胎植入前非整倍體基因檢測(niPGT-A)
            盡管胚胎活檢被認為是一種相對安全的方法,但其他侵入性較小的技術近也受到關注。研究表明,可以通過檢測釋放到培養(yǎng)基中的游離DNA(cfDNA),即無創(chuàng)胚胎植入前非整倍體基因檢測(niPGT-A)來判斷胚胎非整倍體情況。由于cfDNA的含量遠少于侵入式活檢的細胞DNA,因此具有高靈敏度和低偏差的WGA方法對于niPGT-A獲得足夠的材料進行下游分析至關重要。
            來自南加州大學的Jacqueline團隊【3】,通過對廢胚胎培養(yǎng)基(SEM)中提取的cfDNA進行全基因組擴增,分析胚胎染色體的非整倍性,驗證無創(chuàng)胚胎植入前基因檢測非整倍體檢測(niPGT-A)的可靠性。實驗分別對SEM,滋養(yǎng)外胚層細胞和完整胚胎樣本使用PicoPLEX進行WGA,然后利用NGS方法進行PGT-A分析。結果表明,使用63.2 ng/ul的cfDNA足以用于正確的進行染色體異倍性分析,但一致性略低。這也表明,PicoPLEX技術可以提供高質量的基因組DNA, 助力niPGT-A分析。

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