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一般而言，色譜分析過程是靠流動相中的樣品和固定相的結合-分離差異達到分離物質的作用，溫度可以影響結合-分離過程，從而影響色譜分析過程。改變柱溫對分離度和峰形是有影響的,但影響比較小，影響色譜柱分離度的因素是固定相的種類、性質（粒度、粒徑分布等）、填充狀況、柱長、流動相的種類和流速及測定柱效所用物質的性質等。
具體如下：
1、色譜長度和填料的性質，色譜柱越長，組分之間分辯效果越好，但色譜柱越長壓降越大，而輸入的壓力是有限的。色譜柱過長會增大進出口壓力比，相反會降低分離度；
2、色譜柱填料顆粒大小也是主要因素，粒子越細，由于表面積增加，分辯效果越好，但是顆粒細會增大柱壓降，也會起反作用；
3、柱溫對分辯效果也有很大影響，因為氣體在液體中的溶解度或在固體表面的吸附程度都隨溫度增高而降低，在氣液色譜分析中，當超過一定溫度時，靜態的液體通常會從色譜柱中揮發掉，所以選擇柱溫時應考慮到樣品的沸點。一般是略低于樣品沸點的平均值；
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