根據(jù)目的和功能可分類，其中最重要的兩類是選擇培養(yǎng)基和鑒別培養(yǎng)基。選擇培養(yǎng)基是指在營(yíng)養(yǎng)介質(zhì)中加入了一些特殊物質(zhì)，讓我們需要的微生物才能夠生長(zhǎng)。比如在培養(yǎng)基中加入了慶大霉素，那么只有能夠抵抗慶大霉素的微生物才能夠生長(zhǎng)，而這種抵抗多數(shù)情況下是我們?cè)谶@些微生物的基因中插入了抗性基因后才具有的功能。

　　鑒別培養(yǎng)基用于鑒別不同類型微生物的培養(yǎng)基。在培養(yǎng)基中加入某種特殊的化學(xué)物質(zhì)后，導(dǎo)致不同微生物在培養(yǎng)基上生長(zhǎng)后，產(chǎn)生明顯的特征性變化，根據(jù)這種特征性變化，可將該種微生物與其他微生物區(qū)分開來。比如使用酸堿指示劑可以區(qū)別產(chǎn)酸菌和產(chǎn)堿菌。

　　一、發(fā)酵培養(yǎng)皿的營(yíng)養(yǎng)成分

　　微生物的食物在發(fā)酵上的俗語叫培養(yǎng)基。培養(yǎng)基是指供給微生物生長(zhǎng)繁殖的，由不同營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)組合，由人類配制而成的營(yíng)養(yǎng)基質(zhì)。碳水化合物、含氮物質(zhì)、無機(jī)鹽（包括微量元素）、維生素和水等幾大類物質(zhì)是培養(yǎng)基應(yīng)該包含的成分。

　　1.碳源營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)

　　碳源主要指碳水化合物，它是碳、氫和氧三種元素組成的化合物，包括葡萄糖，淀粉等，前者是單糖，后者是多糖。它們?cè)谏w內(nèi)分解，然后形成能量和重要的基本單元，這些能源和基本單元成為微生物體內(nèi)合成蛋白質(zhì)，核酸等功能性大分子的基礎(chǔ)。

　　2.氮源營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)

　　氮源是指含有氮元素的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，分兩類，一類是無機(jī)氮源，如氨水，硫酸銨，尿素等；另一類是有機(jī)氮源，如氨基酸，蛋白質(zhì)等。它們?cè)谖⑸矬w內(nèi)被分解和利用，是合成蛋白質(zhì)的重要原料。

　　3.其他營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)

　　無機(jī)鹽也起到重要作用，一方面它們是微生物體內(nèi)催化劑的激活劑，另一方面可以調(diào)節(jié)細(xì)胞的滲透壓。

　　二、培養(yǎng)基的分類

　　1.根據(jù)原料分類

　　根據(jù)配制原料的來源可分為天然培養(yǎng)基、合成培養(yǎng)基、半合成培養(yǎng)基。

　　天然培養(yǎng)基，顧名思義，原料取自天然，或者將天然產(chǎn)物簡(jiǎn)單處理后獲得的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)組合，比如玉米，玉米粉，玉米漿，比如牛肉，牛肉膏，酵母粉，魚粉，淀粉等；

　　合成培養(yǎng)基是指化學(xué)成分清楚，在制作時(shí)使用純凈物或近似純凈物，如葡萄糖、氯化鈉，氨基酸，維生素等，配制用的水一般也選擇純水；

　　半合成培養(yǎng)基又稱半組合培養(yǎng)基，指用天然原料加入一定的化學(xué)試劑配制而成的培養(yǎng)基。其中天然成分提供碳、氮源和生長(zhǎng)素。化學(xué)試劑補(bǔ)充各種無機(jī)鹽。

　　2.根據(jù)形態(tài)分類

　　可分為固體培養(yǎng)基、液體培養(yǎng)基、半固體培養(yǎng)基；固體培養(yǎng)基可讓微生物生長(zhǎng)在表面，液體培養(yǎng)基可讓微生物沉浸在其中，而且可以自由游動(dòng)。半固體培養(yǎng)介于兩者之間，既以讓微生物沉浸在其中，但是不可自由流動(dòng)。固體培養(yǎng)基一般是在液體培養(yǎng)中加入一些在常溫可凝固的物質(zhì)，如瓊脂等。

　　3.根據(jù)功能分類

　　微生物有生命，沒人知道他們是否喜歡吃菜還是喜歡吃米飯、饅頭？但是全面豐富的營(yíng)養(yǎng)肯定是需要的，而且與人類相比，微生物的食譜更加廣泛，我們的食物不僅他們照單全收，我們不能享用的，也會(huì)成為他們的美肴。