選擇合適的色譜柱可以縮短方法開發時間，并使開發的方法更穩定。色譜柱的選擇包括分離模式、色譜填料基質及基質物理化學性質等。

 

　　反相高效液相色譜柱的保護：

　　1、用預柱。（但要注意，若有時出峰異常，要先看看是不是它有問題了）

 

　　2、每次做完分析，都要進行沖洗，分析用流動相中若無酸、鹽類物質，建議用90%甲醇沖洗30~60min；若分析用流動相中含以上物質，要先用10%甲醇沖洗1小時左右，再梯度走到90%甲醇沖洗30~60min。有必要時再循環幾次，可以適當縮短時間。

　　若長時間不用該色譜柱，要沖洗好后，用純甲酵或乙封存。

 

　　3、若流動相中用到離子對試剤，更應該好好沖洗，且該色譜柱作為專用，不能再做其它物質分析用。因色譜柱填料性質已與原來所不同，在該柱上所摸索的色譜條件，可能在其它同類柱子上得不到重現。

 

　　4、盡量避免反沖，除非該色譜柱明確說明允許。

 

　　5、普通C18柱盡量避免在40℃以上的溫度下分析。

 

　　6、定期測柱效，有下降，可以用10%異丙醇甲醇沖洗色譜柱。若柱效還沒有改善，可以再生，甲醇二氯甲烷一甲。