高壓蒸汽滅菌生物指示劑主要有以下幾種分類方式及不同類型間的區別：

按結構分類

載體型生物指示劑：由微生物芽孢和載體組合包裝而成，載體可以是碟形或條狀的濾紙、玻璃、塑料等材料。適用于驗證和監控非溶液類物品的滅菌工藝，如織物、注射泵等固體物品的滅菌監測。

芽孢懸液生物指示劑：芽孢混懸于液體中。主要用于濕熱滅菌的液體滅菌驗證，能模擬被滅菌液體內部的情況，尤其適用于大體積液體以及無法放置片式或自含式生物指示劑的管道內部滅菌，如培養基、注射液等液體的滅菌監測。

自含式生物指示劑：由芽孢和能夠恢復微生物生長的培養基系統組成。主要用于濕熱滅菌中飽和蒸汽滅菌的驗證，使用方便，只需進行陽性對照，無需像片狀生物指示劑那樣使用陽性對照和陰性對照。

按培養時間分類

通用型生物指示劑：根據芽孢復蘇后指示菌種新陳代謝引起培養液 pH 值改變，通過酸堿指示劑變色來進行判讀，培養時間一般在 24 或 48 小時以上。

快速型生物指示劑：根據芽孢復蘇后的酶促反應，通過熒光進行判讀，時間一般為 3 - 4 小時，能更快地得出滅菌效果監測結果，提高工作效率。

按菌種及適用溫度范圍分類

含嗜熱脂肪芽孢桿菌的指示劑：如 BT21/6、BT22/6、BT23/6 等，適用于 121℃ - 134℃的蒸汽滅菌，常用于醫療衛生、食品、生物產業、制藥等領域中對蒸汽滅菌設備的滅菌效果驗證。

含枯草芽孢桿菌的指示劑：如 BT24/6，適用的滅菌溫度范圍為 110℃ - 121℃，可應用于上述領域中該溫度范圍內的滅菌物品及設備的效果驗證，尤其適用于熱敏性物品的滅菌監測。