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            上海易匯生物科技有限公司

            Illumina MS-102-2003 基因測序試劑用戶指南

            時間:2025-4-21閱讀:261

            Illumina MS-102-2003 基因測序試劑用戶指南

            ——高效、精準的下一代測序解決方案

            一、產品概述

            Illumina MS-102-2003 MiSeq Reagent Kit v2(500 cycles)(貨號:MS-102-2003)是一款專為Illumina MiSeq測序平臺設計的高通量基因測序試劑盒,采用邊合成邊測序(SBS)技術,支持長達500個循環的測序反應,單次運行可生成高達8.5 Gb的數據輸出,適用于全基因組重測序、轉錄組分析、宏基因組學及靶向測序等應用場景。

            核心參數

            • 規格:500 cycles

            • 數據輸出:8.5 Gb(500 cycles)、5.1 Gb(300 cycles)、1.2 Gb(300 cycles Micro Kit)、0.850 Gb(50 cycles)

            • 讀長:雙端測序(Paired-End)支持2×250 bp(標準配置),最長可擴展至2×300 bp

            • 試劑類型:簇生成、雙端測序、邊合成邊測序

            • 系統兼容性:研究模式下的MiSeqDx、MiSeq FGx及標準MiSeq系統

            • 儲存條件:-20℃避光保存,解凍后避免反復凍融

            二、技術優勢

            1. 高通量與長讀長

              • 雙表面成像技術:與v1試劑盒相比,雙表面成像使每個流動槽的通量翻倍,片段數增加2倍。

              • 長讀長支持:500 cycles試劑盒可擴展片段長度,適用于復雜基因組區域解析(如結構變異檢測)。

            2. 高效化學過程

              • 改良的簇密度:通過優化化學配方,簇密度提升30%,減少循環時間。

              • 高質量測序:Q30得分(質量值≥30的堿基比例)≥80%,確保堿基識別準確性。

            3. 靈活配置

              • 多規格選擇:提供50、300、500 cycles三種循環數規格,滿足不同實驗需求。

              • Micro/Nano規格:適用于低通量應用(如Micro Kit:1.2 Gb/300 cycles;Nano Kit:0.5 Gb/500 cycles)。

            4. 智能交互與兼容性

              • RFID編碼:所有組件均采用RFID編碼,與MiSeq系統智能交互,驗證兼容性并減少操作誤差。

              • 廣泛適配:兼容研究模式下的多種MiSeq系統,支持Illumina Advantage大規模測序產品(如特定批次出貨、延長保質期)。

            三、操作指南

            (一)實驗前準備
            1. 試劑與耗材

              • Illumina MS-102-2003 MiSeq Reagent Kit v2(500 cycles)

              • MiSeq測序儀及配套流動槽

              • 文庫構建試劑(如TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina)

              • Qubit定量儀、NaOH變性試劑、冰水混合物(冰:水=3:1)

            2. 文庫準備

              • 使用文庫構建試劑生成測序文庫,并通過Qubit定量儀確定濃度。

              • 將文庫稀釋至4 nM,用NaOH變性后,與預冷的雜交緩沖液(HT1)混合至20 pM終濃度。

              • 添加5%比例的PhiX質控DNA以監控測序質量。

            (二)實驗操作
            1. 試劑盒準備

              • 從-20℃冰箱取出試劑盒,室溫解凍后顛倒混勻。

              • 準備冰水混合物預冷雜交緩沖液(HT1)。

            2. 上機操作

              • 啟動MiSeq測序儀,選擇“Sequence"模式并加載試劑盒。

              • 創建Sample Sheet文件,定義樣本信息及運行參數(如讀長、循環數)。

              • 建議初始上機濃度為4 pM,后續可根據結果調整至8 pM。

            3. 測序運行

              • 單次運行時間:約27-48小時(具體時間取決于讀長和循環數)。

              • 運行結束后,系統自動生成FASTQ格式數據文件。

            (三)實驗后處理
            • 數據分析:推薦使用Illumina BaseSpace平臺或第三方工具(如BWA、GATK)進行數據處理。

            • 試劑盒儲存:未使用的試劑需重新密封,-20℃保存。

            • 廢棄物處理:按實驗室生物安全規范處理。

            四、使用技巧與高效操作

            1. 優化文庫質量

              • 確保文庫片段分布均勻,避免小片段(<100 bp)過量導致測序失敗。

              • 使用Agilent Bioanalyzer或TapeStation驗證文庫質量。

            2. 提高測序通量

              • 結合雙表面成像技術,選擇500 cycles試劑盒以每個流動槽的通量。

              • 對于低通量需求,可選擇Micro或Nano規格試劑盒。

            3. 質量控制

              • 運行前檢查儀器狀態,避免硬件故障導致數據丟失。

              • 監控Q30得分和覆蓋度(目標區域測序深度需≥30×)。

            五、注意事項

            1. 安全規范

              • 操作時佩戴手套與護目鏡,避免試劑接觸皮膚或吸入。

              • 廢棄物需按化學危險品處理。

            2. 操作細節

              • 移液精度:使用校準后的移液器,誤差<±1%。

              • 溫度控制:確保試劑和文庫在規定溫度下儲存和處理。

            3. 故障排除

              • 簇密度過高:降低上機濃度至4 pM以下。

              • 信號飽和:檢查文庫濃度和流動槽狀態。

            六、用戶評價與支持

            • 用戶反饋

              • “MS-102-2003試劑盒顯著提高了測序通量,雙表面成像技術使數據輸出翻倍。"

              • “Q30得分穩定在85%以上,適用于高精度變異檢測。"



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