電壓設置：按下 “電壓" 按鍵，此時顯示屏上的電壓數值會閃爍，通過 “+"“-" 按鍵來調整電壓值，使其達到實驗所需范圍，DYY-16D 的電壓范圍為 (20 ~ 10000) V ，顯示精度達 10V。如進行常規蛋白質電泳，一般設置電壓為 100 - 200V。設置完成后，再次按下 “電壓" 按鍵確認設置。

電流設置：按 “電流" 按鍵，同樣以 “+"“-" 按鍵調節電流數值，該電泳儀電源輸出電流為 (0 ~ 3000)μA，顯示精度為 1μA 。在等電聚焦實驗中，需要精確控制電流，以確保蛋白質在 pH 梯度凝膠中穩定遷移，可根據凝膠的具體情況設置合適的電流值，設置好后再次按 “電流" 鍵確認。

功率設置：操作方法同電壓、電流設置，按下 “功率" 按鍵，調整功率值，DYY-16D 額定輸出功率為 30W 。在對溫度敏感的 RNA 電泳實驗中，合適的功率設置有助于維持凝膠理化性質穩定，防止 RNA 降解，設置完成后確認。

定時設置：若實驗需要設定電泳時間，按 “定時" 按鍵，通過 “+"“-" 按鍵設置所需時間，單位通常為分鐘。例如長時間的核酸序列分析電泳，可設置數小時的電泳時間，設置好后按 “定時" 鍵確認。

伏時模式：若實驗需要使用伏時模式，按 “模式" 按鍵，切換至伏時模式。在此模式下，設置好所需的電壓和時間，電源將在設定時間內維持該電壓輸出。如某些特殊蛋白質分離實驗，需要特定電壓作用一定時間以達最佳效果，就可選用此模式。

線性模式：同樣按 “模式" 按鍵切換至線性模式，然后設置好電壓、電流或功率的起始值、終止值以及變化速率等參數。該模式在模擬復雜電場環境或研究生物大分子在動態電場中遷移行為時應用較多。