島津氣相色譜當樣品進入色譜柱頭以后，流動相把樣品帶入色譜柱內，剛進入柱子時，組分A和B以混合譜帶出現。

　　由于各組分在固定相中的溶解-解析、或吸附-脫附、或其他親和作用力的差異，各組分在色譜柱中的滯留時間也就不同，即它們在柱中的運行速度不同。隨著流動相的不斷流過，組分在柱中兩相間經過了反復多次的分配和平衡過程，當運行一定的柱長以后，樣品中各組分得到了分離。當組分A離開色譜柱出口流過檢測器時，記錄設備就記錄出組分A的色譜峰；繼之當組分B離開色譜柱流過檢測器時，記錄設備就記錄出組分B的色譜峰。

　　由于島津氣相色譜柱中存在著渦流擴散、分子擴散（縱向擴散）、傳質阻力以及其他因素的作用，使得所記錄的色譜峰并不是以一條矩形的譜帶出現，而是一條接近高斯分布曲線的色譜峰。

 

島津氣相色譜在石油化工、醫藥衛生、環境監測、生物化學等領域都得到了廣泛的應用

1．在衛生檢驗中的應用

   空氣、水中污染物如揮發性有機物、多環芳烴[苯、甲苯、苯并（a）比等]；農作物中殘留有機氯、有機磷農藥等；食品添加劑苯甲酸等；體液和組織等生物材料的分析如氨基酸、脂肪酸、維生素等。

2．在醫學檢驗中的應用

   體液和組織等生物材料的分析：如脂肪酸、甘油三酯、維生素、糖類等。

3. 在藥物分析中的應用

   抗癲癇藥、中成藥中揮發性成分、生物堿類藥品的測定等。