島津離子色譜的分離機理主要是離子交換，有3種分離方式，它們是離子交換色譜、離子排斥色譜和離子對色譜。3種分離方式各基于不同分離機理。分離機理主要是離子交換，主要為離子排斥，而MPIC則是主要基于吸附和離子對的形成。

 

島津離子色譜液路中的接頭、密封件絕大多數都是由聚四氟、增強四氟、橡膠、PEEK材料制成的。

先從吸液部分說起。

液相用的吸濾頭大多都是不銹鋼粉末壓制而成的，離子色譜用的是一些塑料材料如聚四氟、PEEK等粉末通過某種方式加工而成的。

吸液管路一般都是透明的聚四氟管，由于是吸液管，阻力還是小一點的好，這個管路一般要短一些，內徑大一些，長度一般都在1.0-1.5m，管外徑一般都是3.2mm，內徑一般都是2.0mm，這個和液相色譜一樣。

單向閥閥球、閥座和液相色譜一樣，都是人造寶石或陶瓷材料。閥體和閥座液相色譜大多都是不銹鋼材料，離子色譜大多都是PEEK材料。

泵頭也是一樣，液相色譜一般都是不銹鋼材料，離子色譜一般都是PEEK材料。也有的為了增加外觀的美觀程度或增加耐壓強度，而把液路用的PEEK材料鑲嵌到了不銹鋼件內。

柱塞桿和液相用的一樣，人造寶石或陶瓷的，高壓密封圈和液相色譜有些區別。端面密封為PEEK、聚四氟、增強四氟等材料件，這個和液相一樣。

中心孔液相有的是不銹鋼材料件，離子色譜用的一般是更能耐腐蝕的純鈦材料件。

柱后清洗由于不在系統液路內，不涉及強腐蝕液體，不用承受高壓，所以液路部件及管路、接頭等件用什么材料也就無所謂了，一般也就和液相色譜的一樣了。

阻尼器、進樣閥液路系統也都是PEEK、聚四氟等材料部件。