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蛋白表達純化中的表達是指用模式生物如細菌、酵母、動物細胞或者植物細胞表達外源基因蛋白的一種分子生物學技術。純化是指利用各蛋白質的差異將目的蛋白從其它蛋白中純化出來的一種生物化學方法。蛋白質量表征是指通過表征蛋白質的二級結構、熱穩定性以及聚集態等信息來評估所獲取蛋白質量的一種物理化學方法。
蛋白表達純化的方法主要可以分為三類沉淀、離心和層析。具體可以分為：
鹽析沉淀是在蛋白質水溶液中加入中性鹽，隨著鹽濃度增大而使蛋白質沉淀出來的方法。等電點沉淀是利用蛋白質在等電點時溶解度低而不同蛋白質又具有不同等電點的特點進行分離的方法。有機溶劑沉淀是利用與水互溶的有機溶劑使蛋白質在水中的溶解度顯著降低而沉淀的方法。
速率區帶離心是根據顆粒在介質中的沉降速度不同來分離試樣的方法。差速離心是逐漸提高離心速度來分離不同大小的細胞器的方法。
疏水相互影響層析是利用蛋白質表面的疏水部位和固定相上的疏水基團的結合來分離不同蛋白質的方法。凝膠層析是利用混合物隨流動性相流過配有凝膠固定不動相的層析柱時速度不一致而分離的方法。由于存在特異性低、純化蛋白純度不高和活性低等缺點，在實際生產中用的頻次比較低。應用較多的純化方法是層析法中的親和層析和離子交換層析。
