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            上海牧榮生物科技有限公司

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            nanopartz等離子 PCR™技術資料

            閱讀:910      發(fā)布時間:2024-01-12
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            等離子 PCR™




            等離子PCR

            現(xiàn)有PCR

            時間

            < 6 分鐘(當前)
            < 1 分鐘(開發(fā))

            > 30 分鐘

            標簽

            無標簽實時監(jiān)測擴增子,對 10 個 DNA 拷貝敏感

            需要標簽

            樣品制備

            自動化、免提、無化學品

            需要大量的樣品制備

            護理點

            電池,便攜式

            功耗大,不便攜

            安全

            固有

            不怎么安全

            兼容性

            兼容 PCR、RT-PCR 和 LAMP 格式

            標準兼容

            渠道

            最多 8 個通道。顯示四通道系統(tǒng)



















            設備描述

            1. 幾秒鐘內的溫度循環(huán)

            我們的技術是通過在 PCR 反應混合物中使用金納米顆粒來實現(xiàn)的。具體來說,Nanopartz 的金納米棒 (GNR) 在暴露于激光時會在飛秒內產生巨大的熱量。通過操縱低功率 808nm 激光器打開和關閉(循環(huán)/秒),加熱是瞬時且極其精確的。 GNR 具有出色的光吸收特性 (>90%),并且將吸收的光轉化為熱量的效率為 100%,達到 20°C/秒的速率。通過非接觸式紅外測溫法進行溫度監(jiān)測(高達 50 次測量/秒)。由于管子是全自由的,沒有埋入塊中,因此通過對流完成冷卻。可以實現(xiàn)簡單、高效且極其快速的熱循環(huán),從而獲得高度特異性的 PCR 產物(圖 1A)。它還與所有現(xiàn)有的 PCR 方案全兼容,具有非常方便的 10-25 µl 反應體積,并且具有在任何規(guī)模上運行的潛力(使用微束激光器,小規(guī)模是可行的)。由于我們的等離子 PCR 的能源需求大大減少,因此可以制造 POC 自供電便攜式版本。

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            1. 等離子 PCR。 A. 顯示 30 循環(huán)等離子體 PCR 實驗的溫度監(jiān)測示例。等離子體系統(tǒng)在較長的延長時間內保持溫度的穩(wěn)定性,請參見放大的突出顯示框。 B. VCSEL 系統(tǒng)示意圖,帶有 UV-LED 和光電探測器放置。

            我們還優(yōu)化了 PCR 的參數(shù)。 PCR 階段僅保持 1-2 秒(延伸和變性)。對于退火步驟,目前 4 秒效果好,并且比傳統(tǒng) PCR 產生高度特異性的擴增子(圖 1A)。這些時間足以產生可靠的最大 >200bp PCR 產物。利用我們目前的等離子 PCR,我們可以在 10 分鐘內完成 30 個循環(huán)的 PCR。等離子 PCR 實現(xiàn)了出色的 PCR 效率以及出色的產量和靈敏度。

            2.無標簽 實時擴增子量化

            我們的等離子 PCR 技術包括實時監(jiān)控擴增子的產生。為了與全光學方法保持一致,我們采用了一種創(chuàng)新方法,不需要熒光標記(即無標記)。這是通過評估 PCR 循環(huán)期間的紫外線吸收特性來實現(xiàn)的。最近,我們對 Plasmonic PCR 進行了改造,使其能夠監(jiān)測實時熒光 PCR,其 Ct 值與傳統(tǒng) qPCR 平臺沒有區(qū)別。這些創(chuàng)新顯著擴大了等離子 PCR 的范圍,實時完成和解釋 PCR。

            image.png

            2. DNA 擴增的 UV 監(jiān)測。 A. 沙眼衣原體 DNA 不同拷貝數(shù)(從 10,000 到 10)的 UV 監(jiān)測繪制結果。UV 監(jiān)測可以自信地測量低至 1,000 個拷貝的確定性。 B.相應實驗的凝膠電泳,顯示10,000個拷貝的DNA擴增子的強度。盡管我們的紫外線監(jiān)測檢測靈敏度提高了 10 倍,但這表示不到 1 CFU。 C. UV 監(jiān)測還可以提供熔解曲線分析,如面板所示。

            擴增子生產的紫外實時監(jiān)控。鑒于我們使用全光學方法進行 PCR,我們繼續(xù)投資于實時光學評估擴增子的產生。我們現(xiàn)在已經使用無紫外線標記方法成功地整合了擴增子生產的實時監(jiān)控。我們的等離激元 PCR 的靈敏度為 10 個 DNA 拷貝分子,與其他診斷平臺保持一致。我們的等離子 PCR 或 RT-PCR 現(xiàn)在具有包容性,可以實時完成和解釋 PCR,無需添加任何類型的標簽(即無標簽)。

            3. 手工和無化學品樣品制備

            樣品制備和滅菌。金納米顆粒可以對反應混合物產生顯著的大量加熱,從而隨后裂解細菌和梭狀芽胞桿菌孢子,事實上我們已經證明了這一點。這對于衛(wèi)生工作者的暴露風險極其重要。

            4. 多渠道

            image.png

            5.與現(xiàn)有 PCR、RT-PCR、qPCR 集成

            6. Point of Care

            7.試劑

            Nanopartz 的金納米棒 (GNR)。通常,只需將 GNR 添加到 PCR 混合物中,無需其他準備工作。最近,我們開發(fā)了室溫穩(wěn)定的凍干 GNR,很容易重新懸浮在水中。這是非常關鍵的,因為人們可以考慮等離子體 PCR 裝置,而無需擔心與制冷要求相關的問題;由于 PCR 混合物的所有成分都可以凍干,因此 POC 實施現(xiàn)在更加容易。


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            上海牧榮生物科技有限公司

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