本快速指南提供了 Covaris 8 AFA-TUBE TPX 條 (PN 520292) 和 96 AFA-TUBE TPX 板 (PN 520291) 消耗品的細胞裂解和蛋白質提取方案，使用三種 Covaris 聚焦超聲儀儀器：ML230、LE220-plus 和LE220Rsc。

本快速指南中提到的值為標稱值。公差如下：

 • 溫度：± 3 °C 

• 樣品體積： - 8 AFA-TUBE TPX 試紙條：± 2.5 µl - 96 AFA-TUBE TPX 板：± 2.5 µl 

• 水位：± 1 mm

樣品指南

 • 輸入：適用于 8 個 AFA-TUBE TPX 條和 96 個 AFA-TUBE TPX 板 

• 福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 卷軸 - 最大 10 µm x ~ 500 mm2 

• < 5 mg 新鮮冷凍組織 

• 哺乳動物細胞 ( 1,000 至 100,000)

 • 緩沖液：組織裂解緩沖液 (TLB) (PN 520284) 

• 警告：請勿使用 AFA-TUBE TPX 條或板進行長期樣品儲存。樣品應在處理后轉移。

儀器設置 • 請參閱特定儀器手冊以了解完整設置。 

• AFA-TUBE TPX 條和板具有與每種儀器相關的特定機架。

FFPE 卷軸實驗方案 使用組織裂解緩沖液處理 FFPE 卷軸的說明。

 • 在每個測試孔中加載約10 µm x 約500 mm2 FFPE 卷軸。 

• TLB 的建議體積為 100 µl，但可根據卷軸尺寸在 75 至 150 µl 之間更改。在每個測試孔中加載 100 µl 組織裂解緩沖液。確保卷軸全浸沒在組織裂解緩沖液中。

 • 脫蠟： - 使用下面 AFA 設置表中描述的“乳化"AFA 條件處理測試孔。 

• 解交聯： - 將AFA-TUBE TPX 板或條放入設定為90 °C 的熱循環儀中90 分鐘。 

• 均質化： - 使用下頁 AFA 設置表中描述的“均質化"AFA 條件處理測試孔。此時可以分析蛋白質提取。將 AFA-TUBE TPX 耗材以 3,000 x g 離心 5 分鐘（平板）或 5000 x g 離心 5 分鐘（條帶）。除去上清液并將其用于定量（BCA 測定）和/或定性分析（SDS-PAGE）。請參閱附錄 A：蛋白質提取驗證了解更多信息。

組織裂解方案 使用組織裂解緩沖液處理組織的說明。 • 將最多5 mg 的組織裝入每個測試孔中。 • 在每個測試孔中加載75 µl 組織裂解緩沖液。確保組織全浸沒在組織裂解緩沖液中。 • 均質化： - 使用下頁 AFA 設置表中描述的“均質化"AFA 條件處理測試孔。此時可以分析蛋白質提取。將 AFA-TUBE TPX 耗材以 3,000 x g 離心 5 分鐘（平板）或 5000 x g 離心 5 分鐘（條帶）。除去上清液并將其用于定量（BCA 測定）和/或定性分析（SDS-PAGE）。

細胞裂解方案 使用組織裂解緩沖液處理細胞的說明。 • 將最多105 個細胞裝入每個測試孔中。 • 在每個測試孔中加載40 µl 組織裂解緩沖液。 • 均質化： - 使用下頁 AFA 設置表中描述的“均質化"AFA 條件處理測試孔。此時可以分析蛋白質提取。將 AFA-TUBE TPX 耗材以 3,000 x g 離心 5 分鐘（平板）或 5000 x g 離心 5 分鐘（條帶）。除去上清液并將其用于定量（BCA 測定）和/或定性分析（SDS-PAGE）。

附錄 A：蛋白質提取驗證 可以按照這些方案進行過程驗證。

使用 Covaris 緩沖液的蛋白質提取工作流程的定量性能可以使用 BCA 測定（Pierce™ BCA 蛋白質測定試劑盒，來自 ThermoFisher Scientific 的 PN 23227）進行測試。建議在進行 BCA 測定之前用去離子水將溶液按 1:5 稀釋。此外，BCA 檢測標準品的不同稀釋度應使用相同的稀釋劑（使用去離子水按 1:5 稀釋的 TLB 緩沖液）進行。可以使用 SDS-PAGE（4-20% Criterion TGX Stain-Free Protein Gel，來自 Bio-Rad 的 PN 5678093）測試定性性能。根據要求共享對照樣品的定量和定性數據。

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