土壤和湖海沉積物中都含有棕黑色或黑色的腐殖酸，它們對 PCR 等后續反應有極大的抑制作用，所以有效去除土壤中腐殖酸是提取土壤微生物 DNA  的重要環節，但是目前市場上沒有專門的產 品，針對這一情況，上海生工這個產品，專門用于對提取 DNA 用的土壤進行預處理，以清除腐殖酸成分。

1. 清除效果好，一次能使腐殖酸的濃度降低 50%左右。

2. 適合于黃色、紅色、黑色和棕黑色等各種質地的土壤和河海沉積物。

3. 操作過程簡單快速，一次處理只需要 10 分鐘。

4. 擴容性好，可小規模操作， 也可以大規模操作。

 

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疑難解答

如何判斷提取的 DNA 沒有腐殖酸污染？

• 方法一是目測法，即看得到的溶液是否無色。如果呈淡棕黑色或淡黃色，說明可能是少量殘留的未除盡的腐殖酸。

• 方法二是檢測最大光吸收。

注意：有腐殖酸污染并不表示 DNA 不能使用，有的腐殖酸并不抑制 PCR 擴增。

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腐殖酸的最大吸收波長是多少？

• 腐殖酸（humic acid）是一大類呈棕黑色或黑色的物質,其結構千差萬別，土壤中腐殖酸的組成和特點隨土壤不同而不同， 所以其最大吸收波長也各不相同。有的土壤的腐殖酸的最大吸收波長在 260 nm（見 Appl. Environ. Microbiol., 63：4993, 1997），有的則在 340 nm ，所以用特定的波長測定 OD 值時波長的選定要根據土壤而決定。Sigma, Fluka 等公司出售 的腐殖酸產品成分一般比較簡單，其最大吸收波長不能推廣到成分更為復雜的土壤腐殖酸樣品。

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是否腐殖酸都會抑制后續的 DNA 反應？

• 否，因為腐殖酸是一大類物質的統稱，他們的結構和特性各不相同，所以是否對后續反應有影響最好通過實驗來驗證。如果用提取的 DNA 溶液原液進行反應而反應沒發生，而對照樣品 （已知的不含污染的 DNA）能夠發生，說明可能有抑制作用。