溶解多肽是非常復(fù)雜的事情，一般很難一下子確定合適的溶劑。通常是先取一點(diǎn)試驗(yàn)，在沒(méi)有確定合適的溶劑前千萬(wàn)不要全部溶解。
下列方法有助于您選擇合適的溶劑：
(1)判定多肽的電荷特定，設(shè)定酸性氨基酸Asp(D),Glu(E)和C端COOH為-1;堿性氨基酸Lys(K),Arg(R),His(H)及N端NH2為+1,其它氨基酸的電荷為0。計(jì)算出將電荷數(shù)。
(2)如果凈電荷數(shù) >0，多肽為堿性，用水溶解：如果不溶解或溶解性不大，加入醋酸(10%以上);如果多肽還不能溶解，加入少量TFA(25ul)溶解，然后加入500ul水稀釋。
(3)如果凈電荷數(shù)<0，多肽為酸性，用水溶解;如果不溶解或溶解性不大，加入氨水(25ul)溶解，然后加入500ul水稀釋。
(4)如果凈電荷數(shù)=0，多肽為中性，一般需要用有機(jī)溶劑如乙腈，甲醇或異丙醇，DMSO等溶解。還有人建議需要尿素來(lái)溶解疏水性很大的多肽。
多肽合成需要考慮多肽的長(zhǎng)度，電荷，親疏水性等因素。長(zhǎng)度越長(zhǎng)，合成粗品的純度和產(chǎn)率都隨著降低，純化的難度和無(wú)法合成的幾率就會(huì)大些。
當(dāng)然多肽功能區(qū)的序列是無(wú)法改變的，但是為了多肽的順利合成，有時(shí)不得不在功能取的上下游增加一些輔助氨基酸，以改善多肽的溶解性和親疏水性。
如果多肽太短，合成也可能有問(wèn)題，主要問(wèn)題是合成的多肽在后處理過(guò)程中有一定的難度，5肽以下的多肽，一般要有疏水的氨基酸，否則后處理難度加大。15個(gè)氨基酸殘基以下的多肽一般都可以得到滿意的產(chǎn)率和得率。
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