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            瓊脂糖核酸電泳介紹

            時間:2023/11/21閱讀:1151
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            瓊脂糖核酸電泳步驟

            1.    用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗干凈, 放在制膠平板上, 封閉模具邊緣, 架好梳子;

            2.    根據欲分離 DNA 片段大小用凝膠緩沖液配制適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準確 稱量瓊脂糖干粉, 加入到配膠用的三角燒瓶內, 定量加入電泳緩沖液(一般

            20~30 ml);

            3.    放入到微波爐內加熱熔化。冷卻片刻, 加入一滴熒光染料,輕輕旋轉以充分

            混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;

            4.    室溫下 30~45 分鐘后凝膠全凝結, 小心拔出梳子, 將凝膠安放在電泳槽內;

            5.    向電泳槽中倒入電泳緩沖液,其量以沒過膠面 1mm 為宜,如樣品孔內有氣

            泡,應設法除去;

            6.    在 DNA 樣品中加入 10×體積的載樣緩沖液(loading buffer),混勻后,用槍

            將樣品混合液緩慢加入被浸沒的凝膠加樣孔內;

            7.    接通電源, 紅色為正極,黑色為負極, 切記 DNA 樣品由負極往正極泳動 (靠

            近加樣孔的一端為負)。一般 60 ~ 100V 電壓,電泳 20 ~ 40min 即可;

            8.    根據指示劑泳動的位置,判斷是否終止電泳;

            9.    電泳完畢, 關上電源, 在凝膠成像儀上觀察電泳帶及其位置,并與核酸分子

            量標準 Marker 比較被擴增產物的大小。

            瓊脂糖凝膠濃度與線形 DNA 的最佳分辨范圍

            瓊脂糖凝膠濃度

            線形 DNA 的最佳分辨范圍(bp

            0.5%

            1,000  30,000

            0.7%

            800  12,000

            1.0%

            500  10,000

            1.2%

            400  7,000

            1.5%

            200  3,000

            2.0%

            50  2,000

             

            膠回收純化 DNA

            1.   瓊脂糖電泳,將特異電泳帶用刀切下放入到 EP 管中,稱瓊脂糖帶的重量;

            2.   按照每 100mg  400µl 的量加入binding buffer,放入到 EP 管振蕩器中,45 ~

            55溫育振蕩,直到所有的瓊脂糖都溶解(大概要 5 分鐘 );

            3.   取出純化柱, 將上述溶解液轉移至柱中, 室溫下放置 2 分鐘, 8,000rpm   離心

            1 分鐘,棄 EP 管中的液體,將純化柱放回 EP 管中;

            4.    500µl  wash buffer 至柱中, 8,000rpm   離心 1 分鐘。棄管中的溶液;

            5.   重復操作 4 步的操作 1 次,最后將純化柱放入 EP 管中 10,000rpm  離心 30 秒,

            除去痕量的 wash buffer

            6.   將純化柱放入一個新的 EP 管。加 30~40µl H2O 或者 elution buffer 至純化柱膜 的中央,在37 50下放置 2 分鐘, 10,000rpm 離心 1 分鐘洗脫 DNA,將

            EP 管中的 DNA 溶液放在-20保存。

            7.   注: 若想要不電泳而直接純化 DNA 溶液, 只需要在第 2 中按 100µl 液量加 400µl  binding buffer,其余的步驟不變。

             

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