實驗過程中不同的應用會產生不同的污染，微波消解罐對應有不同的清洗方法。

　　1.微波水熱消解罐的常規清洗方法

　　此方法適用于大部分消解后的罐子清洗，步驟如下：

　　1）用熱的清洗液清洗微波消解罐：用海綿或者脫脂棉擦洗微波消解罐內的可見污物，應避免使用硬質毛刷清洗微波消解罐，以避免劃傷微波消解罐，從而造成更容易吸附樣品以及降低罐子使用壽命。

　　2）依次用自來水和去離子水沖洗微波消解罐，干燥后放置在一個干凈且干燥的地方備用。

　　3）蓋子部分不必每次消解完樣品都清洗，一天只需清洗一次，清洗步驟按照清洗液---自來水---去離子水---干燥的步驟清洗即可。

　　4）外套禁止用任何試劑清洗，如有污物或者酸滴用濕布擦拭干凈。

　　5）如果污物中有某些清洗液很難清洗干凈的有機物，則可能需要用到丙酮，二甲苯之類的溶劑，使用此類溶劑清洗微波消解罐時注意殘留溶劑一定要用水沖干凈。

　　6）不同污物所需清洗溶劑：

　　7）痕量分析之前除上述清洗步驟外微波消解罐還需要在10%的硝酸酸缸里浸泡至少24小時。