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            異硫氰酸胍/氯化銫超速離心法制備 RNA 實驗

            閱讀:768      發布時間:2023-07-07
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            材料與儀器

            1. 細胞和組織
            細胞/組織,凍于液氮

            2. 緩沖液、溶液和試劑
            氯仿
            氯化銫溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.01mmol/LEDTA,pH8.0)
            用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水
            二硫蘇糖醇(DTT),0.2 mmol/L
            EDTA,1mmol/L,pH8.0
            乙醇,70%(體積分數)
            異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
            異丙醇
            N-月桂酰肌氨酸,20%200 g/L)
            氯化鋰(LiCl),8mol/L
            液氮
            β-巰基乙醇,10 ml/L
            苯酚, 水飽和,pH4.0
            3. 離心機和轉子
            BeckmanTi50 轉子或相當的轉子
            4. 特殊設備
            研缽和杵,用 DEPC 處理過的水洗滌,預冷
            超速離心管(異質同晶共聚材料),或相當的 Polygon, 或相當的高速勻漿器

            步驟

            1、使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細粉。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質化組織或細胞(達 1X109 個)。
            2、將 4 ml5.7mol/L CsCl 溶液加到超速離心管中。
            3、將 1ml5.7mol/L CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產物中。
            4、將氯化銫/裂解產物混合物混合,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層。
            5、20°C 180000 g 離心 21 h。
            6、移棄氯化銫上清液,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物。
            7、小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中。
            8、加等體積酚,混勻。
            910000g 離心 15 min。
            10、將水相轉移到一新管中。重復水相的酚抽提,直到界面變清。
            11、向清澈的水相加 1 倍體積氯仿。
            12、混合,10000 g 離心 l0 min
            13、將水相轉移到一干凈試管中。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰。10000g 離心10min。
            14、移棄上清液。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,10000 g 離心。
            15、移棄乙酵,風干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L DTT 中。
            16、RNA 儲存于-70°C


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