近年來，CRISPR/Cas9技術飛速發展，使用CRSPR系統將重組Cas9蛋白和合成引導性RNA注入小鼠受精卵，就能很容易的進行基因敲除和敲入。zui近在學術期刊《GenomeBiology》發表的一項研究中，來自英國威康基金會桑格研究所的William CSkarnes博士撰寫題為“Is mouseembryonic stem cell technology obsolete?"的研究亮點文章指出，這些新技術將很快取代使用胚胎干細胞的基因修飾，小鼠胚胎干細胞技術的終結是不可避免的。

自從25年前小鼠胚胎干細胞（ESC）的發現以來，研究人員利用它們的特性，已經在核苷酸的度上，設計了越來越多復雜的遺傳學改變。小鼠ESC因其很快的生長速度、易于轉染和克隆，可高度服從于遺傳修飾。外源供體載體和內源基因組之間較高的同源重組率，通常可在小鼠ESC中得以實現。多年來，基因打靶載體設計的持續改進，使得研究人員能夠設計幾乎攜帶任何所需基因修飾的小鼠。但是，小鼠ESC的性現在正受到CRISPR及相關核酸內切酶Cas的挑戰，后者能直接對小鼠胚胎進行遺傳工程改造。