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            羅氏實時熒光定量PCR儀工作原理詳解

            2025-5-24  閱讀(67)

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            羅氏實時熒光定量PCR儀工作原理詳解

            一、引言

            聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction,PCR)自上世紀80年代問世以來,極大地推動了分子生物學、醫學檢測、環境監測、法醫學和食品安全等多個領域的發展。傳統PCR的終點分析具有一定的局限性,僅能判斷是否擴增成功,難以實現實時監控與定量分析。實時熒光定量PCR(Real-time Quantitative PCR,qPCR)技術應運而生,解決了這一問題。

            羅氏公司研發的 LightCycler® 系列實時熒光定量PCR儀,基于實時熒光檢測與熱循環技術,集成了溫控系統、光學檢測模塊及數據處理系統。本文將系統介紹其工作原理、技術結構及相關參數,為理解儀器操作原理和合理使用提供理論依據。

            二、實時熒光定量PCR的基本原理

            實時熒光定量PCR儀的核心在于實時監測DNA擴增過程中熒光信號的變化,通過熒光染料或探針報告擴增產物的累積量,最終實現對初始模板的定量分析。

            其基本過程包括:

            1. 模板擴增(DNA復制)

            2. 熒光信號產生(通過染料或探針)

            3. 信號采集與分析(每一循環實時讀取)

            1. 擴增原理

            PCR擴增由三個基本步驟循環構成:

            • 變性(Denaturation):95°C,使雙鏈DNA解鏈為單鏈;

            • 退火(Annealing):50–65°C,引物與模板DNA特異性結合;

            • 延伸(Extension):72°C,在Taq酶作用下合成新鏈。

            每一輪擴增,理論上目標序列數量會倍增,經過30–40個循環后即可達到可檢測水平。

            2. 熒光標記方法

            熒光定量PCR的實現依賴于熒光染料或探針系統的加入。目前主要采用以下幾種檢測體系:

            • SYBR Green I染料:與雙鏈DNA結合后發出熒光,適用于通用引物體系;

            • TaqMan探針:結合目標序列后被酶切斷產生熒光釋放,特異性強;

            • 分子信標(Molecular Beacon)Scorpion探針:通過構象變化實現熒光釋放;

            • FRET探針:兩個探針之間發生熒光共振能量轉移,用于高特異性檢測。

            3. 熒光檢測與Ct值概念

            每一輪循環結束后,設備通過激發光照射樣品,記錄熒光強度變化。熒光值超過設定閾值的循環數被稱為Ct(Threshold Cycle),其與起始模板數量呈負相關關系:

            • 初始模板越多,Ct值越小;

            • Ct值差異可反映樣品間表達量差異。

            通過繪制標準曲線或采用ΔΔCt法,可進行絕對或相對定量分析。

            三、羅氏LightCycler® 系統構造與功能模塊

            羅氏 LightCycler® 實時熒光定量PCR儀由以下四大模塊構成:

            1. 溫控系統

            構造

            • 使用帕爾貼元件進行快速加熱與降溫;

            • 96孔金屬模塊與熱蓋形成封閉反應環境;

            • 多點溫度傳感器進行實時監控與調節。

            功能

            • 確保每一孔溫度一致;

            • 準確執行復雜的熱循環程序;

            • 快速升降溫縮短實驗時間,提高效率。

            2. 光學檢測系統

            光源

            • 多通道激發光源(如LED)激發不同熒光染料;

            • 激發波長穩定,能量可控。

            檢測器

            • 采用光電二極管或光電倍增管;

            • 不同波段濾光片組合可實現FAM、HEX、ROX、Cy5等染料識別。

            工作流程

            • 在每一循環結束后,系統進行熒光激發;

            • 熒光信號通過光路系統傳輸至探測器;

            • 同步讀取多個通道信號,支持多重檢測。

            3. 樣品托盤與反應板

            • 采用標準96孔PCR板,方便兼容市場主流耗材;

            • 熱蓋自動調節壓力,防止蒸發;

            • 金屬材質確保良好的熱傳導性。

            4. 控制與分析系統

            • 通過USB或網絡接口連接控制計算機;

            • 使用 LightCycler® 軟件進行程序設置、數據采集與圖像分析;

            • 支持實時曲線、熔解曲線、標準曲線繪制等功能。

            四、典型檢測流程解析

            1. 實驗設計

            • 選擇適合的熒光系統(染料或探針);

            • 設計特異性引物;

            • 準備PCR反應體系(包含模板、引物、酶、dNTP等);

            2. 程序設置

            在軟件中設定熱循環程序,包括:

            • 預變性時間與溫度;

            • 每步溫度、時間、循環次數;

            • 采集熒光的通道與時間點。

            3. 擴增及實時檢測

            • 啟動反應,儀器自動執行升降溫與熒光采集;

            • 實時生成擴增曲線,觀察反應動態;

            • 監測不同通道間數據變化,判斷是否為特異性擴增。

            4. 數據分析

            • 提取Ct值;

            • 應用ΔCt或ΔΔCt法計算表達量變化;

            • 生成標準曲線用于絕對定量;

            • 判斷熔解曲線是否存在非特異產物或引物二聚體。

            五、熔解曲線分析原理(適用于SYBR Green法)

            在擴增結束后,通過升溫過程記錄雙鏈DNA解鏈產生的熒光下降,得到熔解曲線

            • 每一個特異產物對應一個特定的熔解溫度(Tm);

            • 若存在多個Tm峰,提示可能存在非特異擴增或引物二聚體;

            • 可通過曲線平滑、導數計算等方式進行圖像識別。

            六、影響熒光信號準確性的因素

            因素影響表現建議解決方法
            熒光染料濃度過高造成背景信號增加優化反應濃度
            引物二聚體假陽性Ct值設計引物時避免互補區
            光學污染信號不穩定或偏差大定期清潔檢測窗口
            溫控偏差擴增效率不均定期校準溫控模塊

            七、工作原理的應用示例

            1. 基因表達分析

            利用qPCR檢測轉錄本豐度,常用于疾病機制研究、藥效評估、轉基因檢測等。

            2. 病原體檢測

            檢測病毒DNA/RNA(如SARS-CoV-2、HPV、HBV等),適用于臨床診斷和大規模篩查。

            3. 拷貝數變異(CNV)分析

            通過對比Ct值計算基因組中某一區域的拷貝數變化,用于腫瘤研究或遺傳病篩查。

            八、未來技術趨勢

            雖然實時熒光PCR已趨成熟,但其工作原理不斷被擴展與優化,主要方向包括:

            • 數字PCR(dPCR):基于微液滴分隔的絕對定量技術;

            • 微流控PCR芯片:小型化平臺適用于現場快速檢測;

            • 自動化平臺整合:與樣品前處理、數據云分析系統協同工作。

            九、結語

            羅氏實時熒光定量PCR儀通過整合精確的溫控技術與多通道光學檢測系統,實現了對DNA擴增過程的實時監控與定量分析。其工作原理遵循分子生物學與物理光學的基本規律,構建出一個高效的數據生成平臺。在掌握其原理基礎上,科研人員可更加準確地設計實驗、評估數據質量,并進一步拓展其在各類分子分析中的應用潛力。


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