1、流動相不抽濾超聲  

因為塵埃或其它任何雜質微粒都會磨損柱塞、密封環、缸體和單向閥，因此應預先除去流動相中的任何固體微粒。流動相最好在玻璃容器內抽濾，可采用水系濾膜（0.22μm或0.45μm）等濾器，然后超聲15min以上去除液體當中的微小氣泡。泵的入口都應連接砂濾棒（或片），輸液泵的濾器應經常清洗或更換。  

2、儀器運行之前沒有排氣泡  

液相最害怕進入氣泡，不僅影響泵的正常運轉，進入色譜柱后，還會影響流動相的流速和流量，引起基線的起伏不穩定。因此液體進入儲液瓶之前得排氣泡，上機之后也得排氣泡才能正常運行進入色譜柱。  

3、使用后沒有及時清洗泵  

流動相不應含有任何腐蝕性物質，含有緩沖液的流動相不應保留在泵內，尤其是在停泵過夜或更長時間的情況下。如果將含緩沖液的流動相留在泵內，由于蒸發或泄漏，甚至只是由于溶液的靜置，就可能析出鹽的微細晶體，這些晶體將和上述固體微粒一樣損壞密封環和柱塞等。因此，必須泵入純水將泵充分清洗后，再換成適合于色譜柱保存和有利于泵維護的溶劑（對于反相鍵合硅膠固定相，可以是甲醇或甲醇-水）。  

4、流動相走空  

泵工作時要留心防止溶劑瓶內的流動相被用完，否則空泵運轉也會磨損柱塞、缸體或密封環，最終產生漏液。