離子阱質譜技術作為現代科學儀器的一種，質譜儀主要用于檢測樣本中的化學成分種類和含量。

　　

　　中心各開了一個孔，離子從上面進來下面出去，周圍的環狀電極（一圈）就是鍋壁，離子就被限制在這個鍋里運動，不同質荷比離子在阱里有不同的運動軌道，進來的離子就在特定的軌道上旋轉，改變射頻電壓，可以讓特定質荷比的離子從下面出來，進入檢測器，而其他的離子繼續被關在阱里旋轉運動。

　　

　　離子阱質譜技術的優點：

　　1、結構簡單，體積小，容易抽真空，所以便攜式質譜會采用離子阱。

　　2、由于離子阱可以將某個離子限制在阱里面做軌道運動，所以可以對這個離子做二次碎裂（一般做法是加入氦氣，讓氦氣分子和離子進行碰撞碎裂），對二次碎裂后產生的碎片離子再進行碎裂，產生三級碎片，這個叫做多級質譜。離子阱比較容易實現多級質譜，所以對某個特點物質的定性，多級質譜是個很有用的工具。