選擇色譜柱時，分析化學家做出的最重要的決定是選擇哪種色譜柱固定相。

固定相的化學成分直接影響選擇性參數，它決定了化合物是否可以得到最大的保留，以及它們的洗脫順序。對于非極性固定相，化合物的分離效果受沸點的影響。然而，要解析沸點相似的化合物(如異構體)，通常需要高選擇性或極性固定相。下圖列出了一些優異的色譜柱固定相，按極性遞增的順序排列。

△圖1：毛細管氣相色譜固定相的化學成分示例和相應的珀金埃爾默品牌色譜柱，按非極性(左)到極性(右)列出（點擊查看大圖）

分析人員通常使用30m色譜柱進行分離。

增加分析柱長的確可以提高效率和分辨率，從理論上來說，60m的柱長可以提供30m柱長兩倍的理論塔板數，這看上去似乎很理想。

但是色譜柱長度翻倍并不能使分辨率翻倍，分辨率隨著長度的平方根成比例提升。同時，就像色譜中所有其他因素一樣，增加柱長帶來收益的同時，也有成本上升的問題。

氣相色譜中最常用的兩種內徑是0.25mm和0.32mm。

當減小柱內徑時，效率提高，可以更快分離分析物并且出峰更高，更清晰。例如，在開發特別復雜的多組分混合物的分離方法時，應選擇盡可能窄的色譜柱。

然而，與這一優點相抵消的是，樣品容量隨著直徑縮小呈指數性下降，如下圖所示。盡管大口徑和更大口徑色譜柱可以承受數百至數千納克的高濃度進樣，但解析單個組分的能力受到限制。對于組分較少的樣品以及分辨率較高的分析物，寬口徑色譜柱可以避免復雜的樣品制備/稀釋，并加快分析。

△圖2：修改柱內徑的效益：內徑增大時，柱上可接受的化合物質量相較每米塔板數呈指數增長

在分析分離過程中，固定相(即膜)控制著化學分配。因此，我們提供了多種膜厚度不同的固定相。雖然通常認為0.25 μm的膜為“標準”，但理想的膜厚度可能因不同的應用或相而異。

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