DNA甲基化詳解

一、表觀遺傳與甲基化DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。DNA甲基化：在DNA甲基轉移酶的作用下，基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶（C）5'碳位共價鍵結合一個甲基基團。DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變，從而控制基因表達。二、甲基化研究方法目前研究中常用的DNA甲基化測序方法包括全基因組（WGBS）、簡化基因組（RRBS）、靶向基因組（液相捕獲）、甲基化DNA免疫沉淀（MeDIP-seq）和芯片等，適用于多種不同應用場景。1、甲基化發現階段Illumina EPIC 芯片（935K)：全面覆蓋CpG島、啟 動子等，還包括 島外的CpG位點，已知的DMR位點全基因組甲基化測序（WGBS）：全 基 因 組 覆 蓋 甲 基 化 和 非 甲 基 化甲基化捕獲測序(MC-seq)：啟動子、已知的DMRs、CpG 島、shores簡化基因組甲基化測序（RRBS）：CpG島、啟動子甲基化DNA免疫沉淀（MeDIP-seq）2、甲基化驗證階段焦磷酸測序：焦磷酸測序技術(pyrosequencing)是一種新型的酶聯級聯測序技術，可在一次檢測中快速定量一個或多個甲基化位點，其可重復性和精確性能與SangerDNA測序法相媲美，是目前理想的驗證方法。同時，焦磷酸測序技術產品具備對大量樣品進行測序分析的能力，為大通量、低成本、適時、快速、直觀地進行甲基化分析和臨床檢驗提供了平臺。

多重目的區域甲基化富集測序：多重目的區域甲基化富集測序，是在全基因組甲基化水平的觀察與研究后，對于眾多目的基因的甲基化水平的重要研究手段，更有針對性和大樣本可行性。使用亞硫酸氫鹽處理DNA后，結合目的區域富集和二代測序技術，利用多重目的區域甲基化富集測序技術實現個性化目的區域甲基化測序，同時大大降低了研究費用。