Omicron譜系出現(xiàn)多個變體，誰將成為下一代毒王？

前  言

截止到10月份，Omicron已演化出400多株后代譜系，BA.2、BA.4、BA.5等被關注，演化出更強的傳播力或免疫逃逸能力。

在WHO的周報告中指出，從9月24日到10月24日的一個月間，通過GISAID共享的新冠序列均為Omicron及其后代譜系。其中BA.5及后代譜系繼續(xù)占主導地位，占提交序列的77.1%。位居第二的是BA.4(包括BA.4.6)及后代譜系，占5.4%；BA.2(包括BA.2.75)及后代譜系的流行度有所增長，占比4.3%；近期重組突變株占到共享序列的1.4%，主要由于XBB和其子代譜系的增長。并且已經(jīng)出現(xiàn)傳播速度超過BA.5的譜系。有些突變體的RBD出現(xiàn)了R346、K356、K444、L452、N460K或F486的趨同變異，可能對現(xiàn)有的抗體藥及康復期血清表現(xiàn)出更強的逃逸能力。

隨著秋冬季節(jié)的到來，這些在加速傳播的后代變異體，是否會進化出新一代的毒王成為焦點。近期，科學家們分析了監(jiān)測中的Omicron突變株序列，以下這些毒株，值得進一步研究和關注。

1 BF.7 

BF.7屬于BA.5的后代譜系。據(jù)CDC檢測數(shù)據(jù)，從9月底開始短時間內(nèi)就從1.7%增加到6.7%。在比利時，9月份25%的感染病例與BF.7相關。在國內(nèi)，BF.7與內(nèi)蒙古疫情相關，并已在多地檢出。除了傳播速度快，BF.7的RBD還有R346T突變，可能會出現(xiàn)更強的免疫逃逸。

圖一 新冠變異株監(jiān)測數(shù)據(jù)（Monitoring Variant Proportions. CDC.2022）

2 BQ.1和BQ.1.1

BQ.1和BQ.1.1屬于BA.5的后代譜系，CDC監(jiān)測的數(shù)據(jù)顯示其已躍居美國第三位和第四位的突變體（見圖一）。截止10月25日，全-球65個國家共提交8077條序列。BQ.1和BQ.1.1除傳播速度高于BA.5外，在RBD區(qū)域增加的N460k、K444T、R346T（僅BQ.1.1）使它特別擅長避開之前的免疫，導致疫苗及治療無效。

BA.5及其后代譜系RBD突變位點（源自Cao Y, et al）

3 XBB 

XBB是BA.2.10.1和BA.2.75的雜交變體，截至2022年10月25日，35個國家報告了XBB及其子代毒株XBB.1（在Spike蛋白上增加了G252V）序列。與BA.2相比，XBB在Spike蛋白上演化出14個額外的突變。實驗室的初步證據(jù)表明XBB是迄今為止發(fā)現(xiàn)的免疫逃逸最-強的突變體。XBB的免疫逃逸能力不僅來源于RBD區(qū)域增加的突變，還和NTD區(qū)域的突變有關，尤其是V83A。接種3劑科興疫苗，且感染BA.5的康復期病人血清對XBB表現(xiàn)出很差的中和滴度，顯示再感染的風險增加。在XBB流行率占50%的新加坡，監(jiān)測數(shù)據(jù)顯示XBB可能會導致更多重復感染病例。

新出現(xiàn)的Omicron亞型逃避中和抗體（源自Cao Y, et al）

義翹神州作為新冠病毒科研試劑的主要供應商之一，已開發(fā)一系列備受關注的Omicron子代毒株的重組蛋白及假病毒產(chǎn)品，涵蓋BA.1.1、BA.2、BA.1 x BA.2、BA.2.12.1、BA.2.9.1、BA.2.13、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.4、 BA.4.6、BA.5、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、XBB、BM.1.1等等，以支持對Omicron深入研究。

義翹神州突變株驗證數(shù)據(jù)

01高純度

SARS-CoV-2 BA.4.6/BF.7 (Omicron) Spike RBD Protein (His Tag)，Cat：40592-V08H140

Purity: ≥95% as determined by SDS-PAGE & HPLC

02高活性

ELISA檢測結(jié)果：有ACE2結(jié)合活性

Immobilized human ACE2 protein (Cat#: 10108-H05H) can bind BA.4.6/BF.7 Spike RBD Protein

【參考資料】

1. cov-lineages.org/lineage_list.html

2. covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions

3. 【防疫小貼士】那些關于奧密克戎變異毒株BF.7的事.澎湃新聞客戶端

4. Qu P, et al. Distinct Neutralizing Antibody Escape of SARS-CoV-2 Omicron Subvariants BQ. 1, BQ. 1.1, BA. 4.6, BF. 7 and BA. 2.75. 2. bioRxiv, 2022.   

5. World Health Organization. weekly epidemiological update, edition 115, 26 October 2022

6. Cao Y et al. Imprinted SARS-CoV-2 humoral immunity induces converging Omicron RBD evolution. bioRxiv, 2022.