泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)是一種高度調(diào)控的機(jī)制,通過(guò)蛋白質(zhì)的泛素化和降解來(lái)控制許多細(xì)胞過(guò)程。泛素通過(guò)其C末端與目標(biāo)蛋白上的賴(lài)氨酸殘基結(jié)合,可以以單體形式或聚合鏈形式存在。泛素鏈可以通過(guò)泛素的第一個(gè)甲硫氨酸(M1)形成線(xiàn)性鏈,也可以通過(guò)其七個(gè)賴(lài)氨酸殘基(K6、K11、K27、K29、K33、K48、K63)形成特定賴(lài)氨酸鏈。K48和K63連接的泛素鏈?zhǔn)羌?xì)胞中最為主要的多泛素化形式。
泛素化是一個(gè)可逆的過(guò)程,去泛素化酶(DUBs)可以去除目標(biāo)蛋白上的泛素,從而拯救它們免于蛋白酶體降解。確定目標(biāo)蛋白上的多泛素化程度和類(lèi)型對(duì)于理解它們?cè)谡<?xì)胞過(guò)程以及與UPS相關(guān)疾病狀態(tài)中的泛素介導(dǎo)調(diào)控至關(guān)重要。傳統(tǒng)上,這些過(guò)程是通過(guò)質(zhì)譜分析或使用抗泛素抗體進(jìn)行免疫沉淀后,再進(jìn)行免疫印跡來(lái)監(jiān)測(cè)的。然而,在免疫印跡步驟中,由于表位掩蓋、親和力降低或蛋白質(zhì)多泛素化導(dǎo)致的選擇性變化,底物抗體常常與底物的多泛素化形式產(chǎn)生不同的相互作用。
圖1:UbiTest檢測(cè)的示意圖:通過(guò)磁性TUBEs捕獲富集泛素化蛋白,然后從TUBEs中洗脫。分離的多泛素化洗脫液被分成兩部分:一部分保持未處理狀態(tài),而第二部分用廣譜去泛素化酶(DUB)消化以去除泛素鏈。兩部分均使用針對(duì)目標(biāo)蛋白(POI)的抗體進(jìn)行免疫印跡分析。從多泛素化POI上去除泛素鏈后,在免疫印跡中可以看到一個(gè)單一的、未修飾的POI條帶。
一種更明確的證明蛋白質(zhì)泛素化的方法是,在免疫印跡分析之前,將免疫沉淀與使用廣譜去泛素化酶(DUB)進(jìn)行去泛素化相結(jié)合。如果在經(jīng)過(guò)DUB處理后,目標(biāo)蛋白(POI)的信號(hào)增強(qiáng),這表明該蛋白即使在未處理的樣本中沒(méi)有明顯的反應(yīng)性,也已經(jīng)發(fā)生了泛素化。
LifeSensors的UbiTest檢測(cè)利用TUBEs(串聯(lián)泛素結(jié)合實(shí)體)來(lái)捕獲多泛素化蛋白,以避免由于POI免疫反應(yīng)性變化而可能出現(xiàn)的問(wèn)題。TUBEs是經(jīng)過(guò)工程改造的串聯(lián)泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域,其與多泛素的解離常數(shù)在納摩爾范圍內(nèi)。LifeSensors的泛選擇性TUBEs已被證明能夠結(jié)合所有八種泛素連接類(lèi)型。
為了確定目標(biāo)蛋白上多泛素化的連接類(lèi)型,LifeSensors開(kāi)發(fā)了一種更具針對(duì)性的方法,該方法在免疫印跡分析之前使用特定連接類(lèi)型的DUB。如果在經(jīng)過(guò)K48/K63特異性DUB處理后,與未修飾POI對(duì)應(yīng)的條帶信號(hào)增強(qiáng),則表明該蛋白發(fā)生了K48/K63多泛素化。
艾美捷UbiTest緩沖液(#LSS-UM-0411-3000)相關(guān)產(chǎn)品:
UE103:UbiQuant S試劑盒
UE905:UbiQuant Ultra微孔板
UM413:K63連接特異性UbiTest試劑盒——瓊脂糖TUBE洗脫試劑盒
UM201-1MG:抗泛素TUBE 1,His6
UM102:TUBE 2(GST)
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