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一、全自動多肽合成儀設備校準與準備
安裝與調試
由專業技術人員進行設備的安裝和調試，確保設備能夠正確運行。
檢查溶劑儲液瓶與氣體管道是否連接好，儀器各部分是否完好。
打開合成儀電源開關及壓縮空氣開關，檢查壓力是否符合范圍(如“AIR”表壓力大于60psi而小于100psi；“N2”表壓力大于5psi而小于10psi)。
校準與測試
根據制造商的說明書進行設備的校準和測試，確保所有系統(如泵、閥、檢測器等)都運行正常。
進行溫度、條形碼、反應器混合攪拌、取液針、氨基酸推瓶的測試；電磁閥測試；化學試劑瓶和氨基酸瓶的流量校準；UV控制校準。
選擇合適的反應容器
根據合成規模選擇合適的反應容器，并確保容器的材料不會與反應物或溶劑發生反應。
二、試劑與材料準備
試劑準備
準備合成用的氨基酸、活化試劑、溶劑等，確保所有材料都是新鮮且純凈的，以避免雜質的引入。
根據合成方案，按照所需的物質比例進行稱量，確保準確性。
將試劑依次裝入各貼有相應標簽的儲液瓶內。
樹脂準備
將樹脂加入固相合成儀中，用適當的溶劑(如DCM)溶脹樹脂，然后抽干。
使用DMF等溶劑洗滌樹脂，以去除雜質，洗滌結束后抽干備用。
三、合成操作
設置反應條件
根據所需多肽的序列和長度設定合適的反應條件，包括溫度、壓力、時間等。
脫保護
去除前一個氨基酸的保護基團，使其能夠與下一個氨基酸發生反應。
例如，使用40%三氟乙酸/二氯甲烷溶液脫保護，之后用二氯甲烷、甲醇等洗滌。
偶聯
將新的氨基酸與已脫保護的氨基酸結合，形成肽鍵。
將第一個氨基酸(通常從C端開始)用一定體積的DMF溶解，并加入縮合劑(如DCC、HBTU等)進行活化。
將活化后的氨基酸溶液投入固相合成儀中，補充DMF至適當反應濃度，攪拌進行縮合反應。
洗滌
清洗掉未反應的物質和副產物，確保反應的純度。
每完成一步合成后，都需要通過洗滌來清除反應產生的副產品和未反應的原料，減少雜質的積累。
重復步驟
重復脫保護和偶聯步驟，直到多肽鏈達到預定長度。
四、產物切割與提純
樹脂裂解
配置裂解液(通常包含TFA等強酸)，并提前置冰柜中冷藏保存。
將肽樹脂加入反應釜中，加入預冷的裂解液，攪拌反應以將多肽從樹脂上裂解下來。
裂解結束后放出反應液，抽濾除去樹脂并以TFA等溶劑洗滌。
多肽純化
將裂解液轉入旋轉蒸發儀中室溫濃縮至小體積。
使用適當的沉淀劑(如甲基叔丁基醚)使多肽析出，并通過離心、洗滌等步驟得到粗肽。
使用高效液相色譜(HPLC)等方法對粗肽進行純化，以去除雜質并分離出目標多肽。
濃縮、過濾與凍干
將純化后的多肽溶液旋蒸除去有機溶劑，得到濃縮的多肽溶液。
對濃縮后的多肽溶液進行無菌過濾。
將過濾后的多肽溶液置于凍干機中，設定適當的升溫程序進行凍干處理。
五、質量控制與記錄
監控反應進程
使用適當的檢測方法(如紫外檢測、質譜分析等)監控反應進程，確保每一步的反應都按預期進行。
記錄與報告
詳細記錄每一步的操作參數和結果，包括試劑使用量、反應時間、溫度、壓力等。
生成實驗報告，總結合成過程中的關鍵數據和產物純度等信息。
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