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            48道基因合成儀誤差來源及分析

            來源:蘇州守真儀器設(shè)備有限公司   2025年06月18日 17:47  
              一、48道基因合成儀設(shè)備相關(guān)誤差:
              1. 加樣系統(tǒng)誤差
              移液精度波動(dòng):
              不同通道的移液泵或閥可能存在差異,導(dǎo)致加樣量不一致(如堿基單體分配不均)。
              長(zhǎng)期使用后,移液部件磨損或堵塞,造成體積偏差。
              交叉污染:
              通道之間密封性不足,導(dǎo)致液體殘留或揮發(fā)物擴(kuò)散,引起堿基或酶污染。
              2. 溫度控制誤差
              反應(yīng)體系溫差:
              48通道加熱模塊的溫度均勻性不足,部分孔位溫度偏高或偏低,影響延伸效率。
              升溫/降溫速率不一致,導(dǎo)致PCR或連接反應(yīng)不同步。
              熱蓋壓力不均:
              熱蓋與反應(yīng)板接觸不緊密,部分孔蒸發(fā)嚴(yán)重,改變反應(yīng)體系體積。
              3. 檢測(cè)系統(tǒng)誤差
              熒光/吸光度檢測(cè)偏差:
              不同通道的光學(xué)檢測(cè)器靈敏度差異,導(dǎo)致對(duì)合成效率的判斷失誤。
              背景噪聲干擾(如熒光淬滅或散射),影響實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)準(zhǔn)確性。
              4. 機(jī)械故障
              磁珠分離或振蕩混勻不均:
              磁力模塊磁場(chǎng)強(qiáng)度差異,導(dǎo)致磁珠回收效率不同,影響洗滌或純化效果。
              振蕩頻率或時(shí)間不一致,導(dǎo)致反應(yīng)混合不充分。
              二、48道基因合成儀的操作與流程誤差:
              1. 程序設(shè)置錯(cuò)誤
              參數(shù)輸入偏差:
              合成周期(如延伸時(shí)間、變性溫度)設(shè)置不當(dāng),導(dǎo)致片段長(zhǎng)度或錯(cuò)配率升高。
              未根據(jù)模板類型(如GC含量高、二級(jí)結(jié)構(gòu))調(diào)整參數(shù)。
              自動(dòng)化腳本漏洞:
              多步驟程序(如切割、連接、純化)銜接不當(dāng),導(dǎo)致反應(yīng)中斷或過度處理。
              2. 樣本加載問題
              加樣順序或位置錯(cuò)誤:
              人工加樣時(shí)未按規(guī)范操作(如未更換槍頭),引入外源DNA污染。
              不同通道的起始物料量差異(如引物濃度不同),導(dǎo)致合成效率不均。
              3. 純化與回收效率低
              磁珠或硅膠膜純化損失:
              純化過程中小片段DNA(如短寡核苷酸)吸附損失,降低產(chǎn)量。
              洗滌不徹*,殘留鹽或雜質(zhì)抑制后續(xù)反應(yīng)。
             

             

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