資料簡介
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樣本采集與保存
采集:根據(jù)檢測目的確定采樣部位。若檢測水稻種子,要確保種子無霉變、蟲蛀,隨機(jī)選取一定數(shù)量的種子,一般不少于 100 粒,以保證樣本的代表性。對(duì)于水稻植株,可采集葉片,選取生長良好、無病蟲害的葉片,用干凈剪刀剪取適量,一般每份樣本采集 1 - 2 克葉片。
保存:采集后的樣本需及時(shí)處理。若不能立即處理,種子可置于干燥、陰涼處保存,避免受潮;葉片樣本可放入自封袋中,排除空氣后密封,放入冰箱冷藏(4℃左右),保存時(shí)間不宜超過 3 天,以防核酸降解。
樣本研磨
設(shè)備選擇:可使用研缽和研杵手動(dòng)研磨,也可選用組織研磨儀等電動(dòng)設(shè)備。手動(dòng)研磨適合少量樣本,操作簡單但效率較低;組織研磨儀能同時(shí)處理多個(gè)樣本,效率高且研磨效果均勻。
操作步驟:將樣本放入研缽或研磨儀的研磨管中,加入適量的液氮(液氮可使樣本迅速冷凍,便于研磨)。若用手動(dòng)研缽,用研杵快速研磨樣本,直至呈粉末狀;若用組織研磨儀,設(shè)置合適的研磨時(shí)間和頻率,一般研磨時(shí)間為 1 - 3 分鐘,頻率為 20 - 30 次/秒,研磨完成后樣本也應(yīng)呈均勻粉末狀。
核酸提取
試劑選擇:常用的核酸提取試劑有 CTAB 法試劑盒、磁珠法試劑盒等。CTAB 法試劑盒成本較低,但操作步驟相對(duì)復(fù)雜;磁珠法試劑盒操作簡便、快速,且提取的核酸純度較高。
操作流程:以 CTAB 法為例,將研磨好的樣本粉末轉(zhuǎn)移至離心管中,加入 CTAB 提取液,65℃水浴 30 - 60 分鐘,期間不時(shí)顛倒混勻。水浴后加入氯仿 - 異戊醇(24:1),輕輕顛倒混勻,12000 rpm 離心 10 - 15 分鐘。取上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入異丙醇,輕輕顛倒混勻,-20℃沉淀 30 分鐘以上。12000 rpm 離心 10 分鐘,棄上清,用 75%乙醇洗滌沉淀 2 次,晾干后加入適量的 TE 緩沖液溶解核酸。
核酸純化與濃度測定
純化:可使用乙醇沉淀、柱純化等方法進(jìn)一步純化核酸。乙醇沉淀可去除殘留的鹽離子和小分子雜質(zhì);柱純化則利用特定的吸附柱,能高效去除雜質(zhì),提高核酸的純度。
濃度測定:使用紫外分光光度計(jì)測定核酸的濃度和純度。一般核酸在 260 nm 處有最大吸收峰,通過測量 260 nm 和 280 nm 處的吸光度值,計(jì)算 A260/A280 的比值。比值在 1.8 - 2.0 之間說明核酸純度較高,可用于后續(xù)檢測。根據(jù)測定的濃度,將核酸稀釋至合適的濃度,一般轉(zhuǎn)基因水稻檢測中核酸濃度控制在 10 - 100 ng/μL。
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