MDHS-0002 小鼠細胞STR鑒定

一、小鼠細胞STR鑒定服務簡介

      STR（Short Tandem Repeat，短串聯重復序列）是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA 串聯重復序列，其核心序列重復次數存在個體差異多態性，因此STR也被稱為細胞的DNA指紋。據估計，已建立的細胞系中，約20%是錯誤的細胞類型或物種起源，約30%存在種間或種內交叉污染(ICLA受污染細胞清單)。細胞系的交叉污染和錯誤辨識已成為生物醫學基礎研究和生物醫藥產業的重大危害，并導致科學研究結論錯誤、結果不可重復、臨床細胞治療失敗等。因此NIH、ATCC、Science和Nature等機構多次發出呼吁并要求研究者對細胞進行鑒定。無論是文章投稿、基金申請、細胞治療還是構建細胞庫，細胞是否有“身份”都是重要環節。

     依據美國國家標準技術研究所NIST 和ATCC 建議的9個四堿基重復位點：18-3、9-2、6-7、5-5、X-1、15-3、12-1、6-4、4-2和Jarid1。并額外添加人源位點CSF1PO和vWA，用于鑒定人鼠細胞交叉污染。

    美德華生小鼠細胞STR鑒定：本科研單位實驗室20位點的小鼠細胞STR分型檢測：18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3、6-4、13-1、11-2、17-2、12-1、5-5、X-1   + TH01、D5S818。采用人鼠復合擴增體系檢測人類細胞中的小鼠細胞污染，主要應用在干細胞研究領域。同時可以用于判斷人鼠細胞混淆的情況。

二、小鼠細胞STR鑒定服務內容

（一）小鼠細胞STR鑒定服務流程

（二）小鼠細胞STR鑒定服務特點

      1．采用國際目前的STR檢測技術。采用小鼠基因分型試劑盒（Mouse STR v3.0）對18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3、6-4、13-1、11-2、17-2、12-1、5-5、X-1等18個小鼠STR位點（與CELLOSAUROUS數據庫一致）和2個人源STR位點（同時監控是否有人源細胞交叉污染）進行復合擴增，在ABI 3130XL型遺傳分析儀上對擴增產物進行檢測。

      2．靈敏度高?？梢澡b別細胞樣本中含有的少量其他人源和小鼠細胞污染，檢測線為皮克級。

      3．參考國際細胞鑒定委員會（ICLAC）發布的細胞鑒定標準：其中舊版（ASN-0002-2011）。

      4．鑒定報告中文版或中英版（自選），以及圖譜（見小鼠細胞STR分型檢測圖譜）。報告列舉和標準細胞庫匹配度≥80%的細胞STR數據列表，同時附上STR分型數據結果在標準細胞庫的比對截圖，使結果更加直觀，便于分析理解。

      5．種屬鑒定作為輔助檢測。當對樣本進行小鼠細胞STR分型檢測時，發現是非小鼠的，則進行種屬鑒定，確認樣本種屬。

（三）小鼠細胞STR鑒定注意事項

      1．樣品寄送：用戶提供DNA或細胞 樣本，加冰袋運輸；同時請注明細胞數量或DNA含量，DNA 含量大于50ng/μl，體積大于20μl。如提供細胞，請提供PBS細胞懸浮液，離心沉淀，去上清液，可常溫特快專遞運輸（京外客戶推薦方法）；細胞數量≥10⁶個。

      2．正常檢測周期5-7個工作日，加急2-3個工作日。同時，可以提供小鼠細胞STR分型檢測整體解決方案，即提供ABI 3130xl和配套的試劑軟件，技術培訓，實現自行檢測，控制檢測時間。

      3．本單位所提供的小鼠細胞STR分型檢測可分為科研級，工業級?？蒲袡z測：遵循ISO17025原則，樣本、數據長期保存，不支持現場審查；工業級：遵循ISO17025原則，樣本、數據長期保存，支持現場審查。

（四）小鼠細胞STR鑒定結果交付

      檢測結果以電子版的形式發放到訂單或合同上面預留的郵箱，書面報告可根據需要隨時提供，寄送到貴單位。

三、小鼠細胞STR鑒定20位點

      小鼠細胞20個基因座檢測：18個小鼠位點+2個人源位點。位點如下：