Western Blot（WB）是檢測一個基因表達是否正確及表達量多少的方法。WB操作簡單，既可以定性分析表達產(chǎn)物，同時還可以指示目的蛋白量的相對變化。作為一種有活性的生物大分子，抗體和抗原的反應是比較復雜的，因此用來測定表達產(chǎn)物時存在著一定的不確定性。所以，在WB實驗設計中加入良好的參照體系，對實驗結(jié)果分析是非常有幫助的。 參照體系通常包括分子量Marker（用來確定蛋白條帶對應的分子量大小），空白載體對照（如果是誘導表達體系還應該有誘導前的對照），已知量標準產(chǎn)物的正對照，此外還有內(nèi)參。
內(nèi)參是zui容易被忽略的一項，如果要用WB比較不同條件下或者不同組織中，目的蛋白表達量的相對多少，等量的細胞上樣才有比較的基礎。特別表達量不高時，上樣量的差別就很可能影響結(jié)果的分析，所以此時內(nèi)參就顯得尤為重要。
內(nèi)參即是內(nèi)部參照（Internal Control），對于哺乳動物細胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白（Housekeeping Proteins），它們在各組織和細胞中的表達相對恒定，在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照物。在WB實驗中，除了需要進行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上樣電泳、轉(zhuǎn)膜、靶蛋白抗體孵育、顯色等步驟以外，還需要進行內(nèi)參的檢測，以校正蛋白質(zhì)定量、上樣過程中存在的實驗誤差，保證實驗結(jié)果的準確性。
蛋白濃度測定是比較各種樣品間上樣量的*方法。然而各種蛋白質(zhì)濃度定量方法都存在局限性，不能*準確的確定各種樣品的準確蛋白濃度。如UV法直接定量，適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質(zhì)，相對于比色法來說，操作簡單，但是容易受到平行物質(zhì)的干擾，如DNA的干擾；且敏感度低，要求蛋白的濃度較高。比色法測定蛋白濃度一般有BCA，Bradford，Lowry 等幾種方法。BCA法與Lowry法都容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾。Bradford 法敏感度zui高，且與一系列干擾Lowry，BCA 反應的還原劑（如DTT，巰基乙醇）相容。但是對于去污劑依然是敏感的，其zui主要的缺點是不同的標準品會導致同一樣品的結(jié)果差異較大，無可比性。另外，蛋白質(zhì)定量以后進行電泳時需要等量上樣，此步驟也存在操作誤差。在WB實驗時使用內(nèi)參，即可簡便地對定量和上樣步驟產(chǎn)生的誤差進行校正。
在WB中使用內(nèi)參其實就是在WB過程中的另外用內(nèi)參對應的抗體檢測內(nèi)參，這樣在檢測目的產(chǎn)物的同時可以檢測內(nèi)參的表達，由于內(nèi)參在各組織和細胞中的表達相對恒定，借助檢測每個樣品內(nèi)參的量就可以用于校正上樣誤差，這樣半定量的結(jié)果才更為可信。此外使用內(nèi)參可以作為空白對照，檢測蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否*、整個WB顯色或者發(fā)光體系是否正常。
實驗結(jié)果分析其實很簡單：如果樣品蛋白量有限，只夠進行一次電泳轉(zhuǎn)膜實驗時，分別檢測樣品的內(nèi)參量和目的蛋白量。將各樣品目的蛋白量分別除以其內(nèi)參含量，得到的數(shù)值即為內(nèi)參校正后的各樣品中目的蛋白相對含量，再用此數(shù)值進行樣品間的比較和分析，得到目的蛋白含量在不同樣品間的實際變化結(jié)果。如果樣品量充分，可以先檢測內(nèi)參，觀測樣品間內(nèi)參顯色條帶是否一致，根據(jù)差異大小調(diào)整各樣品的上樣量重新進行Western Blotting實驗，至內(nèi)參量一致為止；若內(nèi)參一致，即可進行不同樣品間目的蛋白表達變化分析。常用的蛋白質(zhì)內(nèi)參有GAPDH（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase）和細胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin。
