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            上海嘉鵬

            主營產(chǎn)品: 超微量分光光度計(jì),核酸蛋白檢測儀,超微量紫外分光光度計(jì),nano光度計(jì),超微量核酸蛋白檢測儀

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            200444
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            核酸探針標(biāo)記的實(shí)驗(yàn)過程

            2016-3-9 閱讀(3226)

            實(shí)驗(yàn)原理

            分子生物研究中,zui常用的探針即為雙鏈DNA探針,它廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因植物拷貝數(shù)的鑒定、臨床診斷等方面。雙鏈DNA探針的合成方法主要有下列兩種:切口平移法和隨機(jī)引物合成法。

            切口平移法(nick translation) 當(dāng)雙鏈DNA分子的一條鏈上產(chǎn)生切口時(shí),E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可將核苷酸連接到切口的3'羥基末端。同時(shí)該酶具有從5'→3'的核酸外切酶活性,能從切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同時(shí)又在切口的3'端補(bǔ)上核苷酸,從而使切口沿著DNA鏈移動,用放射性核苷酸代替原先無放射性的核苷酸,將放射性同位素?fù)饺氲胶铣尚骆溨小ui合適的切口平移片段一般為50-500個(gè)核苷酸。切口平移反應(yīng)受幾種因素的影響: (a) 產(chǎn)物的比活性取決于[α-32P]dNTP的比活性和模板中核苷酸被置換的程度。(b) DNA酶的用量和E.coli DNA聚合酶Ⅰ的質(zhì)量會影響產(chǎn)物片段的大小。(c) DNA模板中的抑制物如瓊脂糖會抑制酶的活性, 故應(yīng)使用仔細(xì)純化后的DNA。

             

            實(shí)驗(yàn)試劑

            (1) 10×切口平移緩沖液:  0.5M/L Tris-Cl (pH7.2);  0.1M/L MgSO4; 10mM/L DTT;  100ug/ml BSA。

            (2) 未標(biāo)記的dNTP原液:除同位素標(biāo)記的脫氧三磷酸核苷酸外,其余3種分別溶解于50mM/L Tris·Cl (pH7.5)溶液中,濃度為0.3mM/L。

            (3) [α-32P] dCTP或[α-32P]dATP:400 Ci/mM, 10uCi/ul。

            (4)E.coli DNA聚合酶Ⅰ:(4單位/ul):溶于50ug/ml BSA, 1mM/L DTT, 50%甘油,50mM/L Tris·Cl(pH7.5)中。

            (5) DNA酶:1mg/ml。

            (6) EDTA :200mM/L (pH8.0)。

            (7) 10M/L NH4Ac。

             

            實(shí)驗(yàn)步驟

            (1) 按下列配比混合:

            未標(biāo)記的dNTP 10ul

            10×切口平移緩沖液 5ul

            待標(biāo)記的DNA 1ug

            [α-32 P]dCTP或dATP(70uCi) 7ul

            E.coli DNA聚合酶 4單位

            DAN酶 I 1ul

            加水至終體積 50ul

            (2) 置于15℃水浴60分鐘。

            (3) 加入5ul EDTA終止反應(yīng)。

            (4) 反應(yīng)液中加入醋酸銨,使終濃度為0.5M/L, 加入兩倍體積預(yù)冷無水乙醇沉淀回收DNA探針。

             

            注意事項(xiàng)

            1、3H,32P及35S標(biāo)記的dNTP都可使用于探針標(biāo)記,但通常使用[α-32 P]-dNTP。

            2、DNA酶Ⅰ的活性不同,所得到的探針比活性也不同,DNA酶Ⅰ活性高,則所得探針比活性高,但長度比較短。

             

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